La LPO Alsace siège au conseil d’administration de plusieurs structures régionales de protection de l’environnement ou d’éducation à l’environnement. Elle participe également à une trentaine de commissions administratives où elle apporte ses compétences concernant l'avifaune et conseille les gestionnaires ou les responsables dans les décisions liées à la gestion des sites (travaux de renaturation, etc.).

Ces fonctions nécessitent une présence importante de la part des bénévoles et des salariés.

Organismes dont La LPO Alsace est membre :

• Alsace Nature
• ODONAT (Office des DOnnées NATuralistes d’Alsace)
• ARIENA (Association Régionale pour l’Initiation à l’Environnement et  à la Nature en Alsace)
• CINE (Centre d’Initiation à la Nature et à l’Environnement) de Munchausen, Altenach
• SINE (Strasbourg Initiatives Nature Environnement) 
• Association de la Petite Camargue Alsacienne
• GTV (Groupe Tétras Vosges)

Quelques exemples de commissions administratives où siège la LPO :

• CDCFS 67 et 68 (Comités Départementaux de la Chasse et de la Faune Sauvage)
• comités consultatifs des RBD (Réserves Biologiques Domaniales). Exemples : RBD de Daubensand et Guebwiller
• comités de gestion des APB (Arrêtés de Protection de Biotopes). Exemples : APB du plan d’eau de Plobsheim, de la Tête des Faux, du Ried de Zembs, de la Héronnière de Beinheim, de Tagolsheim, du Marais d’Altenstadt, du Feldkopf.
• comités départementaux NATURA 2000
• commité de pilotage des collines sous-vosgiennes