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Listes détaillées des oiseaux nicheurs menacés d'Alsace :
En danger critique : Espèce menacée inscrite sur la Liste Rouge Alsace 
| - Accenteur alpin |
| - Blongios nain |
| - Busard cendré |
| - Busard des roseaux |
| - Canard chipeau |
| - Courlis cendré |
| - Fuligule milouin |
| - Gélinotte des bois |
| - Gobemouche à collier |
| - Gorgebleue à miroir |
| - Grand tétras |
| - Guêpier d'Europe |
| - Locustelle luscinioïde |
| - Petit-duc scops |
| - Phragmite des joncs |
| - Pie-grièche à tête rousse |
| - Pie-grièche grise |
| - Pipit spioncelle |
| - Râle des genêts |
| - Rousserolle turdoïde |
| - Sarcelle d'hiver |
| - Tarin des aulnes |
| - Traquet motteux |
En danger : Espèce menacée inscrite sur la Liste Rouge Alsace
| - Bruant fou |
| - Chevêchette d'Europe |
| - Cochevis huppé |
| - Huppe fasciée |
| - Locustelle tachetée |
| - Martinet à ventre blanc |
| - Merle à plastron |
| - Milan royal |
| - Mouette rieuse |
| - Chouette de Tengmalm |
| - Perdrix grise |
| - Pouillot de Bonelli |
| - Sterne pierregarin |
| - Tarier des prés |
| - Vanneau huppé |
| - Venturon montagnard |
Vulnérable : Espèce menacée inscrite sur la Liste Rouge Alsace
| - Alouette lulu |
| - Autour des palombes |
| - Bec-croisé des sapins |
| - Bergeronnette printanière |
| - Bondrée apivore |
| - Bruant jaune |
| - Bruant proyer |
| - Bruant zizi |
| - Cassenoix moucheté |
| - Chevêche d'Athéna |
| - Engoulevent d'Europe |
| - Faucon hobereau |
| - Faucon pèlerin |
| - Fuligule morillon |
| - Goéland leucophée |
| - Grand Corbeau |
| - Grand-duc d'Europe |
| - Grèbe castagneux |
| - Grive litorne |
| - Harle bièvre |
| - Hirondelle de rivage |
| - Hypolaïs ictérine |
| - Hypolaïs ictérine |
| - Linotte mélodieuse |
| - Milan noir |
| - Oedicnème criard |
| - Petit Gravelot |
| - Pic cendré |
| - Pie-grièche écorcheur |
| - Pipit farlouse |
| - Râle d'eau |